MetaboCraft – Ucz się biochemii z Minecraft

Metabolomika jest dziedziną naukową, która najprościej rzecz ujmując zajmuje się badaniem wszystkich metabolitów obecnych w organizmie. Chodzi o to, że w naszym organizmie znajduje się wiele różnych cząsteczek jak białka, węglowodany , hormony itd. Nasz organizm jest jedną wielką machiną molekularną, którą napędza i reguluje niewyobrażalna ilość różnych związków. Metabolomika jest dziedziną, która cały czas opisuje te wszystkie interakcje . Jak możecie się domyślać, dane które pozyskuje się z takich analiz są niewyobrażalnie wielkie, dlatego proponowanych jest wiele systemów , które klasyfikują, segregują i ułatwiają w poruszaniu się w tej całej masie informacji.

źródło: youtube.com

Okazuje się, że badacze z Glasgow postanowili ułatwić sobie sposób segregowania informacji, wykorzystując znaną  większości grę Minecraft. Dla przypomnienia jest to gra z otwartym światem napisana w języku Java, w której gracz ma nieograniczoną możliwość budowania , modyfikacji 

i ingerowania w otoczenie. Gra mówiąc kolokwialnie przypomina układanie z klocków, tworząc nierzadko niesamowicie złożone struktury i budowle. 

Minecraft jest grą wideo, która wielokrotnie była wykorzystywana w badaniach naukowych (np. jak bogactwo środowiska w Minecraft wpływa na hipokamp u ludzi o którym pisałem wcześniej.) Jednakże badacze tym razem postanowili stworzyć serwer MetaboCraft, w którym w sposób wizualny zaprezentują struktury chemiczne cząsteczek, procesy biochemiczne i interakcje pomiędzy nimi zapewniając (jak to nazwali autorzy) „unikalne doświadczenie informacji biochemicznej”. Projekt ma być przeznaczony dla licealistów jak i studentów.  Aby zrozumieć o czym mowa, twórcy umieścili krótką prezentację tego projektu. 

 

źródło: Youtube

Niestety nie potrafię precyzyjnie opisać tutaj technicznej strony tego pomysłu. Jednakże zainteresowanych odsyłam do artykułu : “MetaboCraft: building a Minecraft plugin

for metabolomics” Czasopismo : Bioinformatics , Oxford.